南通市第二人民医院肾内科是南通市临床重点专科，南通市医学创新团队。由肾内科病房、血液净化中心一区、二区和肾脏病专科门诊组成，是集医疗、教学、科研为一体的专科性较强的科室，是南通市较早开展血液透析单位之一。肾内科拥有病床 25 张，血透总床位70张，CRRT机2台，目前在透血透患者240人，透龄最长的达到34年。现有医师6名，其中主任医师 1人，副主任医师 1人，主治医师 3人，住院医师1人，其中硕士 4人，在读硕士2人。

科室临床特色突出，诊断治疗规范，能熟练诊治各种急慢性肾小球、肾小管及肾间质疾病、肾病综合征、急慢性肾功能衰竭、以及继发性肾脏疾病如糖尿病肾病、高血压肾损害、狼疮性肾炎、痛风性肾病等，全面开展各种血液净化技术，如血液透析、血液透析滤过、血液灌流、连续性血液净化等治疗，能熟练开展经皮肾穿刺活检，临时及长期中心静脉置管术、自体动静脉内瘘成形术、内瘘取栓修补重建术、DSA/超声引导下内瘘球囊扩张术等血管通路技术及腹膜透析。另科室还常规开展风湿科疾病的诊治如系统性红斑狼疮、类风湿关节炎、干燥综合症、痛风、强直性脊柱炎、皮肌炎、白塞病等。